مژگان شجریان یک خرداد ۱۳۴۸ در تهران متولد شد. مژگان شجریان لیسانس موسیقی و نقاشی دارد و کارشناسی ارشدش را هم در رشته‌ی گرافیک گرفته است. پدرش استاد محمدرضا شجریان خواننده ایرانی و مادرش فرخنده گل افشان می باشد. مژگان شجریان دو خواهر بزرگتر بنام راحله و افسانه و یک برادر کوچکتر بنام همایون شجریان دارد و از ازدواج دوم پدرش یک برادر ناتنی بنام رایان دارد. وی زیر نظر نوازندگان ممتاز ایرانی چون محمدرضا شجریان، محمدرضا لطفی، حسین علیزاده و پرویز مشکاتیان تعلیم دیده است.

احسان کرمی، مازیاز میری، برزو ارجمند، صادق نوجوکی در کنار مژگان شجریان در کالیفرنیا .